...
ตรวจสอบไฟล์ Container ของ Tensorflow ที่มีให้ดาวน์โหลดใน Docker hub โดยสามารถตรวจสอบได้จาก
https://hub.docker.com/ใช้คำสั่ง apptiner pull เพื่อดาวน์โหลดไฟล์ Container ที่ต้องการใช้งาน ในที่นี้จะดาวน์โหลดไฟล์ Container ของ Tensorflow เวอร์ชั่นล่าสุดเวอร์ชั่น 2.3.1
Code Block |
---|
username@lanta:~> apptainer pull tensorflow-2.3.1.sif docker://tensorflow/tensorflow:latest2.3.1-gpu |
ตัวอย่างการรัน Training ด้วยโปรแกรม Apptainer
ตัวอย่างการรัน Training นี้จะประกอบด้วย 3 ไฟล์ต่อไปนี้
ไฟล์ Setup.py - ใช้สำหรับการดาวน์โหลด Data
ไฟล์ MNIST.py - ใช้สำหรับทดสอบรัน Training
ไฟล์ submit.sh - ใช้สำหรับส่ง Job รันบนเครื่อง GPU
ไฟล์ Setup.py
Code Block |
---|
# code is taken from https://www.tensorflow.org/tutorials/keras/classification # Tensorflow version 2.3.1 import tensorflow as tf import numpy as np fashion_mnist = tf.keras.datasets.fashion_mnist (train_images, train_labels), (test_images, test_labels) = fashion_mnist.load_data() with open('mnist_data.npy', 'wb') as f: np.save(f, train_images) np.save(f, train_labels) np.save(f, test_images) np.save(f, test_labels) |
ไฟล์ MNIST.py
Code Block |
---|
# this code is taken from https://www.tensorflow.org/tutorials/keras/classification
# the code was modified to using pre-downloaded data instead of downloading from the API.
# Tensorflow version 2.3.1
import tensorflow as tf
import numpy as np
fashion_mnist = tf.keras.datasets.fashion_mnist
#(train_images, train_labels), (test_images, test_labels) = fashion_mnist.load_data()
with open('mnist_data.npy', 'rb') as f:
train_images = np.load(f)
train_labels = np.load(f)
test_images = np.load(f)
test_labels = np.load(f)
class_names = ['T-shirt/top', 'Trouser', 'Pullover', 'Dress', 'Coat',
'Sandal', 'Shirt', 'Sneaker', 'Bag', 'Ankle boot']
# Explore Data
train_images.shape
len(train_labels)
test_images.shape
len(test_labels)
# Preprocess Data
train_images = train_images / 255.0
test_images = test_images / 255.0
tf.debugging.set_log_device_placement(True)
strategy = tf.distribute.MirroredStrategy()
with strategy.scope() :
model = tf.keras.Sequential([
tf.keras.layers.Flatten(input_shape=(28, 28)),
tf.keras.layers.Dense(128, activation='relu'),
tf.keras.layers.Dense(10)
])
model.compile(optimizer='adam',
loss=tf.keras.losses.SparseCategoricalCrossentropy(from_logits=True),
metrics=['accuracy'])
model.fit(train_images, train_labels, epochs=10)
test_loss, test_acc = model.evaluate(test_images, test_labels, verbose=2)
print('\n Test loss:', test_loss)
print('\nTest accuracy:', test_acc)
# MIT License
#
# Copyright (c) 2017 François Chollet
#
# Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a
# copy of this software and associated documentation files (the "Software"),
# to deal in the Software without restriction, including without limitation
# the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense,
# and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the
# Software is furnished to do so, subject to the following conditions:
#
# The above copyright notice and this permission notice shall be included in
# all copies or substantial portions of the Software.
#
# THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
# IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL
# THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
# LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING
# FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER
# DEALINGS IN THE SOFTWARE. |
ไฟล์ submit.sh
...
Code Block |
---|
#!/bin/bash #SBATCH -p gpu # Specify partition [Compute/Memory/GPU] #SBATCH -N 1 -c 16 # Specify number of nodes and processors per task #SBATCH --gpus-per-node=4 # Specify number of GPU per task #SBATCH --ntasks-per-node=4 # Specify tasks per node #SBATCH -t 120:00:00 # Specify maximum time limit (hour: minute: second) #SBATCH -A ltxxxxxx # Specify project name #SBATCH -J JOBNAME # Specify job name module load Apptainer/1.1.6 # Load the Apptainer module apptainer exec --nv -B $PWD:$PWD file.sif python3 file.py # Run your program |
...