บทความนี้อธิบายการใช้งานโปรแกรม Apptainer สำหรับการดาวน์โหลดไฟล์ Container บนระบบ LANTA โดยหัวข้อต่อไปนี้ให้ข้อมูลสรุปเนื้อหาของบทความ เพื่อให้ผู้อ่านสามารถระบุส่วนที่ต้องการอ่านได้อย่างรวดเร็ว
| Table of Contents | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
การเรียกใช้งานโปรแกรม Apptainer
ใช้คำสั่ง
ml av Apptainerเพื่อดูว่ามี Apptainer เวอร์ชั่นไหนบ้างบนเครื่อง LANTA
...
| Code Block |
|---|
username@lanta:~> ml Apptainer/1.1.6 |
การใช้คำสั่ง apptainer pull
ใช้สำหรับการดึงไฟล์ container จาก URI โดยโครงสร้างของการใช้คำสั่ง apptainer pull ประกอบด้วย 3 ส่วนต่อไปนี้
...
--arch stringใช้ระบุ Architecture ของ Container ที่จะดึงจาก Library (ค่าเริ่มต้นเป็น “amd64“)--arch-variant stringใช้ระบุตัวแปร Architecture ของ Container ที่จะดึงจาก Library--dir stringใช้ระบุ Directory สำหรับดาวน์โหลด Container-F, --forceเขียนทับไฟล์ Container เดิม หากมีไฟล์ Container นี้อยู่แล้ว--library stringดาวน์โหลดไฟล์ Container จาก Library ที่ให้ไว้
แหล่งดาวน์โหลดไฟล์ container
แหล่งดาวน์โหลดไฟล์ Container ที่ได้รับความนิยม เช่น
...
https://catalog.ngc.nvidia.com/containers
ตัวอย่างการดาวน์โหลด
ตัวอย่างการดาวน์โหลดไฟล์ Container จาก Library
...
| Code Block |
|---|
username@lanta:~> apptainer pull tensorflowpytorch.sif docker://nvcr.io/nvidia/pytorch:24.05-py3 |
...
| Code Block |
|---|
username@lanta:~> apptainer pull apptainer-images.sif shub://vsoch/apptainer-images |
การดาวน์โหลดไฟล์ Container โดยใช้คำสั่งอื่นๆ
นอกจากการดาวน์โหลดไฟล์ Container ด้วยคำสั่ง apptainer pull แล้ว ยังสามารถใช้คำสั่ง apptainer build และ wget ในการดาว์นโหลดไฟล์ Container ได้ด้วย
...
| Code Block |
|---|
wget https://data.broadinstitute.org/Trinity/TRINITY_SINGULARITY/trinityrnaseq.v2.15.1.simg |
คู่มืออื่นๆที่เกี่ยวข้อง
| Filter by label (Content by label) | ||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
...