| Excerpt | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
การทำให้สามารถสั่งรัน WPS และ WRF ด้วยการ Submit job เพียงครั้งเดียว |
ผู้ใช้งาน WRF model สามารถสร้างโฟลเดอร์ใหม่ (เช่น RunWRF) เพื่อ Submit job ของทั้ง WPS และ WRF พร้อมกันจากโฟลเดอร์นี้ โดยมีขั้นตอนดังนี้
สร้างโฟลเดอร์ใหม่ ชื่อ RunWRF
คัดลอกโฟลเดอร์ ./WRF/test/em_real ด้วยสคริปต์เช่นใน Duplicate ./WRF/test/em_real มายังโฟลเดอร์ RunWRF
คัดลอกโฟลเดอร์ ./WPS ด้วยสคริปต์เช่นใน Duplicate ./WPS มายังโฟลเดอร์ RunWRF
จากโฟลเดอร์ RunWRF นี้ ทำการลิ้งค์ Vtable, ลิ้งค์ข้อมูลนำเข้า, ปรับ namelist.wps, namelist.input ฯลฯ ตามปกติ
Submit job ด้วย Submission script เช่นด้านล่างนี้
| Info |
|---|
However, it is more efficient to run geogrid.exe, metgrid.exe and real.exe using a few CPU cores (but enough memory). |
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
#!/bin/bash
#SBATCH -p compute # Partition or machine type [devel/compute/memory]
#SBATCH -N 1 --ntasks-per-node=40 # Number of nodes and Number of core per node
#SBATCH -t 24:00:00 # Total run time limit (hour:minute:second)
#SBATCH -J RunWRF_Ex1 # Job name (short)
#SBATCH -A projxxxx # Your project account *** {USER EDIT} ***
module purge
module load netCDF-Fortran/4.5.2-iimpi-2019b
module load libpng/1.6.37-GCCcore-8.3.0
module load JasPer/1.900.1-intel-2019b
export JASPERINC=$EBROOTJASPER/include
export JASPERLIB=$EBROOTJASPER/lib
ulimit -s unlimited # MUST have otherwise ERROR
# Run WPS
srun -n4 ./geogrid.exe # Run geogrid.exe using 4 CPU cores (-n4)
srun -n1 ./ungrib.exe # ungrib.exe MUST run in serial (-n1)
srun -n4 ./metgrid.exe # Run metgrid.exe using 4 CPU cores (-n4)
# Run WRF
srun -n8 ./real.exe # Run real.exe using 8 CPU cores (-n8)
srun ./wrf.exe
# It is more efficient to run geogrid.exe, metgrid.exe and real.exe using a few CPU cores (but enough memory). |
How to create the RunWRF folder
1. Create a folder
สร้างโฟลเดอร์ ใหม่ เช่น RunWRF00 แล้วเข้าไปในโฟลเดอร์นั้น
| Code Block |
|---|
mkdir RunWRF00 # Create your new WPS folder
cd ./RunWRF00 |
2. Get the Bash scripts
คัดลอกไฟล์ duplicate_WPS4p4.sh และ duplicate_WRF4p4_emreal.sh จากโฟลเดอร์ /tarafs/data/projects/common/WRF/Others (เช่นเดียวกับใน Duplicate ./WPS และ Duplicate ./WRF/test/em_real)
| Code Block |
|---|
# Copy the prepared script
cp /tarafs/data/projects/common/WRF/Others/duplicate_WPS4p4.sh ./duplicate_WPS.sh
cp /tarafs/data/projects/common/WRF/Others/duplicate_WRF4p4_emreal.sh ./duplicate_emreal.sh |
3. Edit the two Bash scripts
3.1 Edit WPS_DIR in duplicate_WPS.sh
เปิด duplicate_WPS.sh ด้วย Text editor แล้วตั้งค่า Path ไปยังโฟลเดอร์ WPS ลงในตัวแปร WPS_DIR
| Code Block |
|---|
nano duplicate_WPS.sh
# Edit path to WPS folder --> WPS_DIR= |
3.2 Edit WRF_DIR in duplicate_emreal.sh
เปิด duplicate_emreal.sh ด้วย Text editor แล้วตั้งค่า Path ไปยังโฟลเดอร์ WRF ลงในตัวแปร WRF_DIR
| Code Block |
|---|
nano duplicate_emreal.sh
# Edit path to WRF folder --> WRF_DIR= |
4. Run the two Bash scripts
รัน Script ทั้งสองอันโดยใช้คำสั่ง bash
| Code Block |
|---|
bash duplicate_WPS.sh
bash duplicate_emreal.sh |
5. Repeat step 1-4 for more (Optional)
ทำขั้นตอนที่ 1-4 ซ้ำ จนกว่าจะได้จำนวนโฟลเดอร์ RunWRF เท่ากันจำนวน Job ที่ต้องการสั่งเข้า TARA พร้อมๆกัน
RETURN: WRF model
...
Contact Us
ThaiSC support service : thaisc-support@nstda.or.th