บทความนี้อธิบายวิธีการรันสคริปต์ Python บนระบบ LANTA HPC โดยใช้โปรแกรม Apptainer หัวข้อต่อไปนี้ให้ข้อมูลสรุปเนื้อหาของบทความ เพื่อให้ผู้อ่านสามารถระบุส่วนที่ต้องการอ่านได้อย่างรวดเร็ว
| Table of Contents |
|---|
| minLevel | 1 |
|---|
| maxLevel | 6 |
|---|
| outline | false |
|---|
| type | list |
|---|
| printable | false |
|---|
|
ตัวอย่างสคริปต์ Slurm สำหรับการเรียกใช้สคริปต์ Python
สำหรับรันงานบนเครื่อง Compute
| Code Block |
|---|
#!/bin/bash
#SBATCH -p compute # Specify partition [Compute/Memory/GPU]
#SBATCH -N 1 -c 128 # Specify number of nodes and processors per task
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # Specify tasks per node
#SBATCH -t 120:00:00 # Specify maximum time limit (hour: minute: second)
#SBATCH -A ltxxxxxx # Specify project name
#SBATCH -J JOBNAME # Specify job name
module load Apptainer/1.1.6 # Load the Apptainer module
apptainer exec -B $PWD:$PWD file.sif python3 file.py # Run your program |
| Info |
|---|
คำสั่ง -c ใช้ในการระบุจำนวน Core ที่จะใช้งานบนเครื่อง Compute (เต็มเครื่อง : -c 128, ครึ่งเครื่อง : -c 64, 1 ใน 4 ของเครื่อง : -c 32) คำสั่ง -B $PWD:$PWD ใช้เพื่อระบุ Path ของไฟล์ Container และไฟล์สคริปต์ Python เป็น Path ที่ใช้ส่งงานของคุณไปยังระบบ Slurm ของ LANTA
|
สำหรับรันงานบนเครื่อง GPU
| Code Block |
|---|
#!/bin/bash
#SBATCH -p gpu # Specify partition [Compute/Memory/GPU]
#SBATCH -N 1 -c 16 # Specify number of nodes and processors per task
#SBATCH --gpus-per-tasknode=14 # Specify number of GPU per task
#SBATCH --ntasks-per-node=4 # Specify tasks per node
#SBATCH -t 120:00:00 # Specify maximum time limit (hour: minute: second)
#SBATCH -A ltxxxxxx # Specify project name
#SBATCH -J JOBNAME # Specify job name
module load Apptainer/1.1.6 # Load the Apptainer module
apptainer exec --nv -B $PWD:$PWD file.sif python3 file.py # Run your program |
| Info |
|---|
| ใช้ ntasks ใช้ ntasks ใช้ ntasks |
การส่งงานเข้ารันในระบบ
ใช้คำสั่ง sbatch script.sh เพื่อส่งงานของคุณไปยังระบบ Slurm ของ เพื่อส่งงานของคุณเข้ารันบนเครื่อง LANTA
| Code Block |
|---|
username@lanta:~> sbatch script.sh |
คู่มืออื่นๆที่เกี่ยวข้อง
| Filter by label (Content by label) |
|---|
| showLabels | false |
|---|
| max | 5 |
|---|
| spaces | com.atlassian.confluence.content.render.xhtml.model.resource.identifiers.SpaceResourceIdentifier@48ae393 |
|---|
| maxCheckbox | false |
|---|
| showSpace | false |
|---|
| sort | modified |
|---|
| type | page |
|---|
| reverse | true |
|---|
| labels | singularity python container |
|---|
| cql | label in ( "download" , "install_apptainer" , "create_container" , "training" ) and space = currentSpace ( ) |
|---|
|