...

(ภาษาไทย)

การใช้งานโปรแกรม Ansys Fluent

ขั้นตอนการรันโปรแกรม Ansys จะมี 2 ขั้นตอนหลัก คือ

1. การทำ passwordless

การรันโปรแกรม Ansys บนระบบ TARA ครั้งแรก จะต้องทำ passwordless สำหรับการเข้าใช้งานเครื่อง computing units (ตัวอย่างเช่น compute nodes, memory nodes) บนระบบ TARA โดยสามารถทำตามขั้นตอนด้านล่าง ดังนี้

...

1.1 ที่เครื่อง TARA frontend node ทำการสร้าง key สำหรับ login เข้าใช้ TARA computing units  โดยใช้คำสั่ง

$ ssh-keygen -t rsa -b 4096 -C "@tara.nstda.or.th"

...

1.3 ตรวจสอบว่า key (id_rsa.pub) มีการสร้างหรือไม่ โดยใช้คำสั่ง

$ ls -l .ssh/
total 8
-rw-------1 test test 3243 May 21 17:39 id_rsa
-rw-r--r--1 test test 743 May 21 17:39 id_rsa.pub

1.4 ทำการ copy key ไปที่ TARA computing units โดยเปลี่ยนค่า [username] เป็น username ของท่านที่เข้าใช้ระบบ TARA

ssh-copy-id -i .ssh/id_rsa.pub [username]@tara.nstda.or.th

จากนั้นระบุรหัสผ่านของระบบ TARA

2. การ submit job เข้าระบบ TARA

2.1 ทำการสร้างและเข้าไปจัดเตรียม script ไฟล์สำหรับเตรียมรันงานเข้าระบบ TARA โดยใช้คำสั่ง

$ vi ansys.sh

ระบุรายละเอียดตามตัวอย่างด้านล่าง โดยสามารถปรับเปลี่ยนได้ตามการใช้งาน (ดูรายละเอียดเพิ่มเติมได้ที่ การสั่งรัน Job ใน SLURM โดยใช้ script )

#!/bin/bash
#SBATCH -p compute -A pre5003 -t 5-00:00:00
#SBATCH -N 2 --ntasks-per-node=40
#SBATCH -L fluent:1,ansys_hpc:53

module purge
module load ANSYS

export MPI_TMPDIR="/tmp/$SLURM_JOB_USER/$SLURM_JOB_ID"


alias

HOSTSFILE=hostlist-job$SLURM_JOB_ID

if [ "$SLURM_PROCID" == "0" ]; then
   srun hostname -s > $HOSTSFILE
   fluent -r20.1.0 3ddp -t$SLURM_NTASKS -cnf=$HOSTSFILE -ssh -nm -gu -driver null -i journal.jou
   rm -f $HOSTSFILE
fi

exit 0

...

2.2 ตรวจสอบ path ของ input files ว่าเป็นไปตามที่กำหนดไว้ใน journal.jou หรือไม่

2.3 เมื่อเตรียม script (ansys.sh) สำหรับรันงานและตรวจสอบ input files เสร็จเรียบร้อย ทำการ submit job เข้าระบบ โดยใช้คำสั่ง

$ sbatch ansys.sh

...

...

...

(ENGLISH)

How to run Ansys

ขั้นตอนการรันโปรแกรม Ansys จะมี 2 ขั้นตอนหลัก คือTo run Ansys, there are 2 major steps.

1. Setting passwordless

To run ANSYS on TARA, you first have to set passwordless login to computing units (e.g. compute nodes, memory nodes) by following below instruction.

1.1 At TARA frontend, create Key for logging-in to TARA computing unit using

ssh-keygen -t rsa -b 4096 -C "@tara.nstda.or.th"

1.2 Specify details shown in the screen or left them blank and then press ENTER

Enter file in which to save the key (/home/best/.ssh/id_rsa): <ไม่ต้องระบุข้อมูล> [ENTER]
Enter passphrase (empty for no passphrase): <ไม่ต้องระบุข้อมูล> [ENTER]
Enter same passphrase again: <ไม่ต้องระบุข้อมูล> [ENTER]

Your identification has been saved in /home/best/.ssh/id_rsa.
Your public key has been saved in /home/best/.ssh/id_rsa.pub.
The key fingerprint is:
SHA256:yilC3rKweLNBiupcOgavyewERZK17PntdFc1MXIPI0Y @tara.nstda.or.th
The key's randomart image is:
+---[RSA 4096]----+
|.oo .E * |
|.+ . . + * |
| + o .|
| o . . . |
|. = S . |
|+= o o o . |
|=o=.+ * . . |
|B**= + . . |
|XX+o . |
+----[SHA256]-----+

1.3 Check if the key (id_rsa.pub) is created using ls -l .ssh/

ls -l .ssh/
total 8
-rw------- 1 test test 3243 May 21 17:39 id_rsa
-rw-r--r-- 1 test test 743 May 21 17:39 id_rsa.pub

1.4 Copy key to TARA computing unit, change [username] to your username

ssh-copy-id -i .ssh/id_rsa.pub [username]@tara.nstda.or.th

2. Submitting job

2.1 preparing script to run the job using the following command

...

#!/bin/bash
#SBATCH -p compute -A pre5003 -t 5-00:00:00
#SBATCH -N 2 --ntasks-per-node=40
#SBATCH -L fluent:1,ansys_hpc:53

module purge
module load ANSYS

export MPI_TMPDIR="/tmp/$SLURM_JOB_USER/$SLURM_JOB_ID"


alias

HOSTSFILE=hostlist-job$SLURM_JOB_ID

if [ "$SLURM_PROCID" == "0" ]; then
   srun hostname -s > $HOSTSFILE
   fluent -r20.1.0 3ddp -t$SLURM_NTASKS -cnf=$HOSTSFILE -ssh -nm -gu -driver null -i journal.jou
   rm -f $HOSTSFILE
fi

exit 0

...

2.2 checking path of all input files if they are set according to journal.jou or Ansys documentation.

2.3 submitting job using the following command

...