...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
ขั้นตอนสำหรับการติดตั้ง local R library บน TARA HPC.
ทำการเรียกใช้งานโปรแกรม R บน TARA HPC
Code Block language bash $ module purge # Unload all module $ module load R/4.0.3-foss-2020b # Load R software
เรียกใช้โปรแกรมภาษา R โดยใช้คำสั่ง
Code Block $ R
ติดตั้ง R Packages เพิ่มเติม ในตัวอย่างติดตั้ง Biocmanager โดยใช้คำสั่ง
Code Block > install.packages("BiocManager") R จะถามว่าต้องการติดตั้งลงใน Local R library หรือ ไม่ พิมพ์ yes > Would you like to use a personal library instead? (yes/No/cancel) yes Would you like to create a personal library ‘~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0’ to install packages into? (yes/No/cancel) yes
**หมายเหตุ การติดตั้งครั้งแรกจะมีการถาม CRAN ให้เลือก 0-Cloud [https] กด OK
ทำการบันทึกการติดตั้ง โดยทำการ Ctrl +D และ พิมพ์ y
Code Block Save workspace image? [y/n/c]: y
การติดตั้ง Local packages ใน BiocManager
เรียกใช้โปรแกรมภาษา R โดยใช้คำสั่ง
Code Block $ R
เรียกใช้งาน Library ในตัวอย่างคือ BiocManager โดยใช้คำสั่ง
Code Block > library("BiocManager")
ติดตั้ง Packages ของ BiocManager ใน Local โดยใช้คำสั่ง
Code Block > BiocManager::install("BSgenome")
ทำการบันทึกการติดตั้ง โดยทำการ Ctrl +D และ พิมพ์ y
Code Block Save workspace image? [y/n/c]: y