ขั้นตอนสำหรับการติดตั้ง local R library บน TARA HPC.

1. ทำการเรียกใช้งานโปรแกรม R บน TARA HPC

   $ module purge # Unload all module $ module load R/4.0.3-foss-2020b # Load R software

2. เรียกใช้โปรแกรมภาษา R โดยใช้คำสั่ง

   $ R

3. ติดตั้ง R Packages เพิ่มเติม ในตัวอย่างติดตั้ง Biocmanager โดยใช้คำสั่ง

   > install.packages("BiocManager") R จะถามว่าต้องการติดตั้งลงใน Local R library หรือ ไม่ พิมพ์ yes > Would you like to use a personal library instead? (yes/No/cancel) yes Would you like to create a personal library ‘~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0’ to install packages into? (yes/No/cancel) yes

   **หมายเหตุ การติดตั้งครั้งแรกจะมีการถาม CRAN ให้เลือก 0-Cloud [https] กด OK

4. ทำการบันทึกการติดตั้ง โดยทำการ Ctrl +D และ พิมพ์ y

   Save workspace image? [y/n/c]: y

การติดตั้ง Local packages ใน BiocManager

1. เรียกใช้โปรแกรมภาษา R โดยใช้คำสั่ง

   $ R

2. เรียกใช้งาน Library ในตัวอย่างคือ BiocManager โดยใช้คำสั่ง

   > library("BiocManager")

3. ติดตั้ง Packages ของ BiocManager ใน Local โดยใช้คำสั่ง

   > BiocManager::install("BSgenome")

4. ทำการบันทึกการติดตั้ง โดยทำการ Ctrl +D และ พิมพ์ y

   Save workspace image? [y/n/c]: y