Excerpt | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
วิธีการติดตั้ง WRF Preprocessing system |
...
Note |
---|
ต้องใช้หน้าต่างเดียวกันเท่านั้น (ไม่เช่นนั้นต้องทำขั้นตอน 1 และ 3 ใหม่ทุกรอบ) |
Table of Contents |
---|
...
1. Load required modules
ทำการล้างโมดูลที่โหลดไว้ก่อนหน้าทั้งหมด แล้วโหลดโมดูลที่ WPS จำเป็นต้องใช้ โดยใช้คำสั่ง
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
module purge
module load netCDF-Fortran/4.5.2-iimpi-2019b
module load libpng/1.6.37-GCCcore-8.3.0
module load JasPer/1.900.1-intel-2019b # (MUST) JasPer version <2.0 |
Info |
---|
These dependencies should be compiled with the same set of compilers. |
2. Download WPS source code
ดาวน์โหลด WPS เวอร์ชั่นล่าสุดจาก GitHub มายัง Directory ปัจจุบัน
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
git clone https://github.com/wrf-model/WPS # Version 4.40 at the time |
...
สามารถย้ายตำแหน่งโฟลเดอร์ WPS นี้ ด้วยคำสั่ง mv
3. Set environment variables
ทำการตั้งค่า Environment variables ดังแสดงด้านล่าง (User ต้องตั้งค่า Path ไปยังโฟลเดอร์ WRF ลงในตัวแปร WRF_DIR)
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
export WRF_DIR=../WRF # Path to WRF folder *** {USER INPUTEDIT} *** export NETCDF=${EBROOTNETCDFMINFORTRAN:-${EBROOTNETCDF}} # Required export JASPERINC=$EBROOTJASPER/include # For GRIB2 IO (RecommendOptional) export JASPERLIB=$EBROOTJASPER/lib # For GRIB2 IO (RecommendOptional) ### Common mistake :: insert spaces before or after = |
Info |
---|
สามารถดู Path ของโฟลเดอร์ WRF ได้โดยเข้าไปในโฟลเดอร์ WRF แล้วใช้คำสั่ง pwd |
4. Set configure file
4.1 Run ./configure
เข้าไปในโฟลเดอร์ WPS ด้วยคำสั่ง cd ./WPS
ใช้คำสั่ง ./configure
พิมพ์เลข 19 แล้วกด Enter เพื่อเลือกการคำนวณขนานแบบ Distributed memory (dmpar) ด้วย Intel compiler บนระบบปฏิบัติการ Linux x86_64
(ใช้คำสั่ง ./clean -a ก่อน ถ้าหากต้องเริ่ม configure ใหม่)
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
cd ./WPS
./configure
# Type 19, then press Enter <-- Linux x86_64, Intel compiler (dmpar) |
4.2 Edit configure.wps
แก้ไขไฟล์ configure.wps ในโฟลเดอร์ WPS ด้วย Text editor เช่น nano, vi
ทำการเปลี่ยนจาก DM_FC = mpif90 เป็น DM_FC = mpiifort
ทำการเปลี่ยนจาก DM_CC = mpicc เป็น DM_CC = mpiicc
(สำหรับ WRF ที่ลงด้วย sm+dm option ให้เพิ่ม -liomp5 -lpthread ให้กับ WRF_LIB ด้วย)
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
nano configure.wps # Change DM_FC = mpif90 to DM_FC = mpiifort # Change DM_CC = mpicc to DM_CC = mpiicc # (If WRF was compiled with sm+dm option, also append -liomp5 -lpthread to WRF_LIB) |
Expand | ||
---|---|---|
| ||
|
5. Compile WPS
เริ่มทำการติดตั้ง WPS โดยบันทึกการแจ้งต่างๆลงในไฟล์ compile.wps.log แทน (ใช้เวลาประมาณ 5 นาทีบน TARA front-end)
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
./compile >2>&1 | tee compile.wps.log |
...
เข้าระบบ TARA อีกหน้าต่างหนึ่ง (ไม่ต้องทำขั้นตอน 1 หรือ 3 ใหม่)
มายังโฟลเดอร์ WPS
ใช้คำสั่ง tail -F compile.wps.log
6. Check
ใช้คำสั่ง ls -ls ./*.exe เพื่อตรวจหา geogrid.exe, metgrid.exe และ ungrib.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.exe เพื่อตรวจหา avg_tsfc.exe, calc_ecmwf_p.exe, g1print.exe, g2print.exe, height_ukmo.exe, int2nc.exe, mod_levs.exe และ rd_intermediate.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.ncl เพื่อตรวจหา gfs.ncl, plotfmt.ncl, plotfmt_nc.ncl และ plotgrids.ncl
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
ls -ls ./*.exe # Check if geogrid.exe, metgrid.exe and ungrib.exe are present ls -ls ./util/*.exe # Check if avg_tsfc.exe, calc_ecmwf_p.exe, g1print.exe, g2print.exe, # height_ukmo.exe, int2nc.exe, mod_levs.exe and rd_intermediate.exe are present ls -ls ./util/*.ncl # Check if gfs.ncl, plotfmt.ncl, plotfmt_nc.ncl and plotgrids.ncl are present |
NEXT: Geography data --- for WPS geogrid.exe
...
Contact Us
ThaiSC support service : thaisc-support@nstda.or.th