Compile WPS

การติดตั้งโปรแกรม WRF Preprocessing System (WPS) มีขั้นตอนดังนี้

A variant of WRF must be compiled prior to WPS.

ต้องใช้หน้าต่างเดียวกันเท่านั้น (ไม่เช่นนั้นต้องทำขั้นตอน 1 และ 3 ใหม่ทุกรอบ)

1 1. Load required modules
2 2. Download WPS source code
3 3. Set environment variables
4 4. Set configure file
- 4.1 4.1 Run ./configure
- 4.2 4.2 Edit configure.wps
5 5. Compile WPS
6 6. Check
7 NEXT: Geography data --- for WPS geogrid.exe

1. Load required modules

ทำการล้างโมดูลที่โหลดไว้ก่อนหน้าทั้งหมด แล้วโหลดโมดูลที่ WPS จำเป็นต้องใช้ โดยใช้คำสั่ง

module purge
module load netCDF-Fortran/4.5.2-iimpi-2019b
module load libpng/1.6.37-GCCcore-8.3.0
module load JasPer/1.900.1-intel-2019b          # (MUST) JasPer version <2.0

These dependencies should be compiled with the same set of compilers.

2. Download WPS source code

ดาวน์โหลด WPS เวอร์ชั่นล่าสุดจาก GitHub มายัง Directory ปัจจุบัน

git clone https://github.com/wrf-model/WPS # Version 4.40 at the time

3. Set environment variables

ทำการตั้งค่า Environment variables ดังแสดงด้านล่าง (User ต้องตั้งค่า Path ไปยังโฟลเดอร์ WRF ลงในตัวแปร WRF_DIR)

export WRF_DIR=../WRF     # Path to WRF folder *** {USER EDIT} *** 

export NETCDF=${EBROOTNETCDFMINFORTRAN:-${EBROOTNETCDF}} # Required
export JASPERINC=$EBROOTJASPER/include                   # For GRIB2 IO (Optional)
export JASPERLIB=$EBROOTJASPER/lib                       # For GRIB2 IO (Optional)
### Common mistake :: insert spaces before or after =

4. Set configure file

4.1 Run ./configure

เข้าไปในโฟลเดอร์ WPS ด้วยคำสั่ง cd ./WPS
ใช้คำสั่ง ./configure
พิมพ์เลข 19 แล้วกด Enter เพื่อเลือกการคำนวณขนานแบบ Distributed memory (dmpar) ด้วย Intel compiler บนระบบปฏิบัติการ Linux x86_64
(ใช้คำสั่ง ./clean -a ก่อน ถ้าหากต้องเริ่ม configure ใหม่)

4.2 Edit configure.wps

แก้ไขไฟล์ configure.wps ในโฟลเดอร์ WPS ด้วย Text editor เช่น nano, vi
ทำการเปลี่ยนจาก DM_FC = mpif90 เป็น DM_FC = mpiifort
ทำการเปลี่ยนจาก DM_CC = mpicc เป็น DM_CC = mpiicc
(สำหรับ WRF ที่ลงด้วย sm+dm option ให้เพิ่ม -liomp5 -lpthread ให้กับ WRF_LIB ด้วย)

Press Ctrl + W # To search
Type “mpif90“, then press Enter # Search using keyword “mpif90“
For the DM_FC , change mpif90 to mpiifort
For the DM_CC, change mpicc to mpiicc
Press Ctrl + O, then press Enter # Save file
Press Ctrl + X # Exit nano

5. Compile WPS

เริ่มทำการติดตั้ง WPS โดยบันทึกการแจ้งต่างๆลงในไฟล์ compile.wps.log แทน (ใช้เวลาประมาณ 5 นาทีบน TARA front-end)

6. Check

ใช้คำสั่ง ls -ls ./*.exe เพื่อตรวจหา geogrid.exe, metgrid.exe และ ungrib.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.exe เพื่อตรวจหา avg_tsfc.exe, calc_ecmwf_p.exe, g1print.exe, g2print.exe, height_ukmo.exe, int2nc.exe, mod_levs.exe และ rd_intermediate.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.ncl เพื่อตรวจหา gfs.ncl, plotfmt.ncl, plotfmt_nc.ncl และ plotgrids.ncl

NEXT: Geography data --- for WPS geogrid.exe

Contact Us
ThaiSC support service : thaisc-support@nstda.or.th

TARA user guide