| Excerpt | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
วิธีการติดตั้ง WRF Preprocessing system |
...
| Note |
|---|
ต้องใช้หน้าต่างเดียวกันเท่านั้น (ไม่เช่นนั้นต้องทำขั้นตอน 1 และ 3 ใหม่ทุกรอบ) |
| Table of Contents |
|---|
...
1. Load required modules
ทำการล้างโมดูลที่โหลดไว้ก่อนหน้าทั้งหมด แล้วโหลดโมดูลที่ WPS จำเป็นต้องใช้ โดยใช้คำสั่ง
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
module purge
module load netCDF-Fortran/4.5.2-iimpi-2019b
module load libpng/1.6.37-GCCcore-8.3.0
module load JasPer/1.900.1-intel-2019b # (MUST) JasPer version <2.0 |
| Info |
|---|
These dependencies should be compiled with the same set of compilers. |
2. Download WPS source code
ดาวน์โหลด WPS เวอร์ชั่นล่าสุดจาก GitHub มายัง Directory ปัจจุบัน
...
สามารถย้ายตำแหน่งโฟลเดอร์ WPS นี้ ด้วยคำสั่ง mv
3. Set environment variables
ทำการตั้งค่า Environment variables ดังแสดงด้านล่าง (User ต้องตั้งค่า Path ไปยังโฟลเดอร์ WRF ลงในตัวแปร WRF_DIR)
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
export WRF_DIR=../WRF # Path to WRF folder *** {USER EDIT} ***
export NETCDF=${EBROOTNETCDFMINFORTRAN:-${EBROOTNETCDF}} # Required
export JASPERINC=$EBROOTJASPER/include # For GRIB2 IO (RecommendOptional)
export JASPERLIB=$EBROOTJASPER/lib # For GRIB2 IO (RecommendOptional)
### Common mistake :: insert spaces before or after = |
| Info |
|---|
สามารถดู Path ของโฟลเดอร์ WRF ได้โดยเข้าไปในโฟลเดอร์ WRF แล้วใช้คำสั่ง pwd |
4. Set configure file
4.1 Run ./configure
เข้าไปในโฟลเดอร์ WPS ด้วยคำสั่ง cd ./WPS
ใช้คำสั่ง ./configure
พิมพ์เลข 19 แล้วกด Enter เพื่อเลือกการคำนวณขนานแบบ Distributed memory (dmpar) ด้วย Intel compiler บนระบบปฏิบัติการ Linux x86_64
(ใช้คำสั่ง ./clean -a ก่อน ถ้าหากต้องเริ่ม configure ใหม่)
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
cd ./WPS
./configure
# Type 19, then press Enter <-- Linux x86_64, Intel compiler (dmpar) |
4.2 Edit configure.wps
แก้ไขไฟล์ configure.wps ในโฟลเดอร์ WPS ด้วย Text editor เช่น nano, vi
ทำการเปลี่ยนจาก DM_FC = mpif90 เป็น DM_FC = mpiifort
ทำการเปลี่ยนจาก DM_CC = mpicc เป็น DM_CC = mpiicc
(สำหรับ WRF ที่ลงด้วย sm+dm option ให้เพิ่ม -liomp5 -lpthread ให้กับ WRF_LIB ด้วย)
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
nano configure.wps # Change DM_FC = mpif90 to DM_FC = mpiifort # Change DM_CC = mpicc to DM_CC = mpiicc # (If WRF was compiled with sm+dm option, also append -liomp5 -lpthread to WRF_LIB) |
| Expand | ||
|---|---|---|
| ||
|
5. Compile WPS
เริ่มทำการติดตั้ง WPS โดยบันทึกการแจ้งต่างๆลงในไฟล์ compile.wps.log แทน (ใช้เวลาประมาณ 5 นาทีบน TARA front-end)
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
./compile >2>& compile.wps.log |
สามารถติดตามการแจ้งระหว่างทำการติดตั้งโดย
...
เข้าระบบ TARA อีกหน้าต่างหนึ่ง (ไม่ต้องทำขั้นตอน 1 หรือ 3 ใหม่)
...
มายังโฟลเดอร์ WPS
...
1 | tee compile.wps.log |
6. Check
ใช้คำสั่ง ls -ls ./*.exe เพื่อตรวจหา geogrid.exe, metgrid.exe และ ungrib.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.exe เพื่อตรวจหา avg_tsfc.exe, calc_ecmwf_p.exe, g1print.exe, g2print.exe, height_ukmo.exe, int2nc.exe, mod_levs.exe และ rd_intermediate.exe
ใช้คำสั่ง ls -ls ./util/*.ncl เพื่อตรวจหา gfs.ncl, plotfmt.ncl, plotfmt_nc.ncl และ plotgrids.ncl
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
ls -ls ./*.exe # Check if geogrid.exe, metgrid.exe and ungrib.exe are present ls -ls ./util/*.exe # Check if avg_tsfc.exe, calc_ecmwf_p.exe, g1print.exe, g2print.exe, # height_ukmo.exe, int2nc.exe, mod_levs.exe and rd_intermediate.exe are present ls -ls ./util/*.ncl # Check if gfs.ncl, plotfmt.ncl, plotfmt_nc.ncl and plotgrids.ncl are present |
NEXT: Geography data --- for WPS geogrid.exe
...
Contact Us
ThaiSC support service : thaisc-support@nstda.or.th