VASP หรือ The Vienna Ab initio Simulation Package เป็น software licenses ทางด้าน Quantum Chemistry สามารถศึกษาข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับโปรแกรมได้ที่ https://www.vasp.at/

ผู้ใช้งานต้องทำการจัดซื้อสิทธิ์การใช้งานกับบริษัทผู้พัฒนาโปรแกรม และทำการติดตั้งโปรแกรมบนระบบ HPC ก่อนเริ่มการใช้งาน โปรดติดต่อ https://www.vasp.at/registration_form/ เพื่อจัดซื้อสิทธิ์การใช้งาน

การใช้งาน VASP version 5.4.4

หากท่านมีสิทธิ์การใช้งาน VASP version 5.4.4 เรียบร้อยแล้ว สามารถส่งหลักฐาน license agreement มายัง thaisc-support@nstda.or.th เพื่อเปิดการใช้งาน VASP module

1. เตรียม Input

ในการใช้งานโปรแกรม VASP จะต้องมีการเตรียม input files ที่ใช้ในการรันดังนี้

INCAR
KPOINT
POSCAR
POTCAR

ศึกษาการเตรียม input สำหรับ VASP ได้ที่ https://www.vasp.at/documentation/

2. การเตรียม Job submission script

2.1 การใช้งานบน compute node

ตัวอย่าง job submission script สำหรับการรันงานบน compute node โดยใช้ 40 CPU-cores และ job time limit 120:00:00 ชั่งโมง ภายใต้ project account train001 (จำเป็นต้องเปลี่ยนเป็น project account ที่ท่านเป็นสมาชิกในโครงการฯ)

ตัวอย่าง job submission script <VASP-test.sh>

#!/bin/bash -l
#SBATCH -p devel                        #specific partition
#SBATCH -N 1 --ntasks-per-node=40       #specific number of nodes and task per node
#SBATCH -t 2:00:00                      #job time limit <hr:min:sec>
#SBATCH -A train001                     #project name
#SBATCH -J VASP-test                    #job name
ulimit  -s unlimited

##Module Load##
module purge
module load VASP/5.4.4-vtst-intel-2019b        

##Run VASP###
srun vasp_std

2. 2 การใช้งานบน memory node

สำหรับการรันงานบน memory node ให้เปลี่ยน #SBATCH -p เป็น memory และสามารถระบุจำนวน CPU-core ได้สูงสุด 192 CPU-cores หากต้องการใช้จำนวน CPU ที่น้อยลง แนะนำให้ระบุจำนวน CPU เป็น 24, 48 หรือ 96 เป็นต้น

#!/bin/bash -l
#SBATCH -p memory                       #specific partition
#SBATCH -N 1 --cpus-per-task=192        #specific number of nodes and task per node
#SBATCH -t 120:00:00                    #job time limit <hr:min:sec>
#SBATCH -J test                         #job name
#SBATCH -A train001                     #project account

3. Job submission

ทำการส่งรันงานในระบบ โดยใช้คำสั่ง sbatch และตามด้วยไฟล์ job submission script

sbatch VASP-test.sh

การใช้งาน VASP